En lithothérapie, elle est considérée comme l'une des pierres les plus précieuses et les plus puissantes.
Elle serait l'une des pierres les plus puissantes pour se protéger des énergies négatives. On l'utilise pour lutter contre les peurs, le stress, la dépression, la colère… et de façon générale pour aider au lâcher-prise.
Elle a une fonction de purification. Elle favorise l'apaisement, le calme. Elle peut ainsi accompagner une séance de méditation ou permettre de trouver le sommeil, pour les adultes comme pour les enfants.
Elle est aussi considérée comme une pierre de séparation. Porter un bijou en améthyste pourra aider à supporter une rupture, un deuil, un départ…
De même, elle accompagne les changements et aide à affronter la nouveauté avec calme, lucidité et ouverture d'esprit.
L'améthyste a également des vertus créatrices. Le peintre de la Renaissance Léonard de Vinci y avait d'ailleurs recours pour améliorer son intelligence et son imagination, et chasser ses idées noires.
On peut utiliser l'améthyste pour améliorer le bien-être physique, notamment en cas de douleurs musculaires ou de maux de tête. On la porte pendant la convalescence pour accélérer la cicatrisation.
Elle est considérée comme une pierre féminine : en agissant sur les hormones, elle peut améliorer la fertilité.